的确，这将产生深远的影响。一套完整且有序的诊疗流程，其中包括患者病史的详细收集、必要的各项检查、明确的诊断以及相应的治疗方案，这几个环节紧密相连，共同维护了医疗行为的科学性和规范性。
然而，如果医生出具的第二份诊断证明与其在医院所做的诊疗记录相抵触，那么我们应该视其为医生本人的主观判断，并不能代表医院的权威诊断结果。因此，这份证明并不具备足够的法律效力，保险公司完全有权不予认可。

《保险法》第五十七条规定：投保人对保险公司理赔决定不服的，可以依据保险合同约定或者与保险公司协商解决；协商不成的，可以申请仲裁或者向人民法院提起诉讼。