车辆有违章不能注销。必须先把违章处理完成才可以注销。一、机动车有下列情形之一的，机动车所有人应当向登记地车辆管理所申请注销登记：
（一）机动车灭失的；
（二）机动车因故不在我国境内使用的；
（三）因质量问题退车的。
二、已注册登记的机动车有下列情形之一的，登记地车辆管理所应当办理注销登记：
（一）机动车登记被依法撤销的；
（二）达到国家强制报废标准的机动车被依法收缴并强制报废的。

《机动车登记规定》第二十八条
除本规定第二十七条规定的情形外，机动车有下列情形之一的，机动车所有人应当向登记地车辆管理所申请注销登记：
（一）机动车灭失的；
（二）机动车因故不在我国境内使用的；
（三）因质量问题退车的。
已注册登记的机动车有下列情形之一的，登记地车辆管理所应当办理注销登记：
（一）机动车登记被依法撤销的；
（二）达到国家强制报废标准的机动车被依法收缴并强制报废的。