鉴于企业破产后，员工工资赔偿问题的重要性，通常遵循如下程序予以解决：
首先，必须对该企业的破产财产做全面且详尽的清算；
其次，在此基础之上，优先清偿破产所产生的各项费用及公益债务；
此后，再根据以下特定顺序逐一清偿相关款项：
首先要偿还的是破产方拖欠职工的工资与医疗福利、残疾补贴、抚恤资金，接下来是需纳入职工个人账户的基本养老保险及基本医疗保险费用的差额，最后是法律与行政法规明确要求支付给职工的补偿金。

《中华人民共和国企业破产法》第一百一十三条
破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后,依照下列顺序清偿:
(一)破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用,所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用,以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金;
(二)破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款;
(三)普通破产债权。
破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的,按照比例分配。
破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。